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Registros recuperados : 38 | |
2. | | LONGHI, S. J.; BOLIGON, A. A.; MURARI, A. B.; HACK, C.; PAULESKI, D. T. Análise florística e estrutural de um fragmento florestal no Município de Jaguari - RS. In: CONGRESSO FLORESTAL ESTADUAL DO RIO GRANDE DO SUL, 9., 2003, Nova Prata, RS. Floresta: função social: anais. Nova Prata: Prefeitura Municipal, 2003. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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6. | | LORENTZ, L. H.; DAL´COL LÚCIO, A.; BOLIGON, A. A.; ZANARDO, B. Tamanho de amostra em função da colheita para pepino tipo conserva em estufa plástica. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 441-442, jul. 2004. Suplemento 1. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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7. | | COCCO. C.; BOLIGON, A. A.; ANDRIOLO, J. L.; OLIVEIRA, C. S.; LORENTZ, L. H. Tamanho e forma de parcela em experimentos com morangueiro cultivado em solo ou em hidroponia. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 7, p. 681-686, jul. 2009. Título em inglês: Plot size and shape in trials using strawberry cultivated with soil or using hydroponics. Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Hortaliças; Embrapa Unidades Centrais. |
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8. | | BOLIGON, A. A.; LOPES, S. J.; DAL'COL LÚCIO, A.; COCCO, C.; PALUDO, A.; ZANARDO, B. Variabilidade espacial da colheita de frutos de pimentão em estufa plastica. Revista Científica Rural, Bagé, v. 14, n. 2, p. 266-278, ago. 2012. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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10. | | BOLIGON, A. A.; LOPES, S. J.; LÚCIO, A. D.; COCCO, C.; ZANARDO, B. Variabilidade espacial da colheita de frutos de pimentão em estufa plástica. Revista Científica Rural, Bagé, v. 14, n. 2, p. 266-278, abr. 2012 Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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11. | | LORENTZ, L. H.; LÚCIO, A. D. C.; BOLIGON, A. A.; LOPES, S. J.; STORCK, L. Variabilidade da produção de frutos de pimentão em estufa plástica. Ciência Rural, Santa Maria, v. 35, n. 2, p. 316-323, mar./abr, 2005. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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12. | | SCHUMACHER, M. V.; BOLIGON, A. A.; BINOTTO, A.; TEIXEIRA, C. P.; SANTOS, F. E. M. dos; BENEDETTI, A. C. Biomassa e nutrientes do material combustível do sub-bosque em uma floresta de Platanus x acerifolia. In: CONGRESSO FLORESTAL ESTADUAL DO RIO GRANDE DO SUL, 9., 2003, Nova Prata, RS. Floresta: função social: anais. Nova Prata: Prefeitura Municipal, 2003. 1 CD-ROM. Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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13. | | CAMPOS, G. S.; BOLIGON, A. A.; YOKOO, M. J. I.; SOLLERO, B. P.; BRACCINI NETO, J.; CARDOSO, F. F. Acurácia da seleção genômica para características de crescimento e escores visuais ao sobreano em bovinos Hereford e Braford. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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14. | | SCHMIDT, P. I.; CAMPOS, G. S.; CAETANO, V. O.; SIMÕES, M. S.; BOLIGON, A. A.; YOKOO, M. J. I. Análise genética de características relacionadas ao crescimento, temperamento e resistência a parasitas na raça Brangus. In: ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO, 20.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 4., 2018, Pelotas. Anais eletrônicos... Pelotas: UFPel, 2018. ENPOS. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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15. | | MENDONÇA, F. S.; LEAL, W. S.; GONÇALVES, G. V. B.; BOLIGON, A. A.; CARDOSO, F. F.; VAZ, R. Z. Fatores de risco de contusões em carcaças bovinas no Rio Grande do Sul. In: JORNADA [DO] NÚCLEO DE ESTUDOS EM SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE E CADEIA PRODUTIVA, 10.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE SISTEMA DE PRODUÇÃO DE BOVINOS DE CORTE, 2., 2015, Porto Alegre. Fronteiras do conhecimento frente a um ambiente de transição na pecuária de corte: resumos expandidos. Porto Alegre: UFRGS, 2015. p. 139-141. Organizadores Gabriel Ribas Pereira, Tamara Esteves de Oliveira, Júlio Otávio Jardim Barcellos. Nespro. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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16. | | REIMANN, F. A.; BOLIGON, A. A.; CAMPOS, G. S.; CARDOSO, L. L.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, F. F. Genetic parameters and accuracy of traditional and genomic breeding values for eye pigmentation, hair coat and breed standard in Hereford and Braford cattle. Livestock Science, v. 213, p. 44-50, July 2018. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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17. | | MELLO, R. M.; LÚCIO, A. D. C.; STORCK, L.; BOLIGON, A. A.; CARPES, R. H.; ZANARDO, B. Definição de parcela para experimentos com culturas olerícolas em estufa plástica. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 21, n. 2, jul. 2003. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 43º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2003. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 21, n. 2, p. 280, jul. 2003. Suplemento 1. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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18. | | OLIVEIRA, K. da S. V.; BOLIGON, A. A.; LEAL, J. J. B.; CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P. Desempenho de terneiros(as) das raças Angus e Braford em diferentes propriedades de pecuaristas familiares do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 6., 2016, Bagé. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2016. p. 23. Claudia Cristina Gulias Gomes, editora técnica. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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19. | | LÚCIO, A. D. C.; MELLO, R. M.; STORCK, L.; CARPES, R. H.; BOLIGON, A. A.; ZANARDO, B. Estimativa de parâmetro para o planejamento de experimentos com a cultura do pimentão em área restrita. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 22, n. 4, p. 766-770, out./dez, 2006. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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20. | | SCHMIDT, P. I.; CAMPOS, G. S.; CAETANO, V. O.; SIMÕES, M. S.; YOKOO, M. J. I.; BOLIGON, A. A. Índices econômicos de seleção para bovinos da raça Brangus. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 27.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 4., 2018, Pelotas. Anais eletrônicos... Pelotas: UFPel, 2018. CIC. Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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Registros recuperados : 38 | |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sul. Para informações adicionais entre em contato com cppsul.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sul. |
Data corrente: |
08/10/2020 |
Data da última atualização: |
08/10/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
A - 1 |
Autoria: |
CAMPOS, G. S.; SOLLERO, B. P.; REIMANN, F. A.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, L. L.; YOKOO, M. J. I.; BOLIGON, A. A.; BRACCINI, J.; CARDOSO, F. F. |
Afiliação: |
Gabriel Soares Campos, UFPEL; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; Fernando Antonio Reimann, UFPEL; Vinicius Silva Junqueira, UFV; Leandro Lunardini Cardoso, UFPEL; MARCOS JUN ITI YOKOO, CPPSUL; Arione Augusti Boligon, UFPEL; José Braccini, UFRGS; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL. |
Título: |
Tag-SNP selection using Bayesian genomewide association study for growth traits in Hereford and Braford cattle. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 137, n. 5, p. 449-467, Sept. 2020. |
DOI: |
https://doi.org/10.1111/jbg.12458 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aim of this study was to perform a Bayesian genomewide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with growth traits in Hereford and Braford cattle, and to select Tag‐SNPs to represent these regions in low‐density panels useful for genomic predictions. In addition, we propose candidate genes through functional enrichment analysis associated with growth traits using Medical Subject Headings (MeSH). Phenotypic data from 126,290 animals and genotypes for 131 sires and 3,545 animals were used. The Tag‐SNPs were selected with BayesB (π = 0.995) method to compose low‐density panels. The number of Tag‐single nucleotide polymorphism (SNP) ranged between 79 and 103 SNP for the growth traits at weaning and between 78 and 100 SNP for the yearling growth traits. The average proportion of variance explained by Tag‐SNP with BayesA was 0.29, 0.23, 0.32 and 0.19 for birthweight (BW), weaning weight (WW205), yearling weight (YW550) and postweaning gain (PWG345), respectively. For Tag‐SNP with BayesA method accuracy values ranged from 0.13 to 0.30 for k‐means and from 0.30 to 0.65 for random clustering of animals to compose reference and validation groups. Although genomic prediction accuracies were higher with the full marker panel, predictions with low‐density panels retained on average 76% of the accuracy obtained with BayesB with full markers for growth traits. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene products related to the growth traits. The proposed Tag‐SNP panels may be useful for future fine mapping studies and for lower‐cost commercial genomic prediction applications. MenosThe aim of this study was to perform a Bayesian genomewide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with growth traits in Hereford and Braford cattle, and to select Tag‐SNPs to represent these regions in low‐density panels useful for genomic predictions. In addition, we propose candidate genes through functional enrichment analysis associated with growth traits using Medical Subject Headings (MeSH). Phenotypic data from 126,290 animals and genotypes for 131 sires and 3,545 animals were used. The Tag‐SNPs were selected with BayesB (π = 0.995) method to compose low‐density panels. The number of Tag‐single nucleotide polymorphism (SNP) ranged between 79 and 103 SNP for the growth traits at weaning and between 78 and 100 SNP for the yearling growth traits. The average proportion of variance explained by Tag‐SNP with BayesA was 0.29, 0.23, 0.32 and 0.19 for birthweight (BW), weaning weight (WW205), yearling weight (YW550) and postweaning gain (PWG345), respectively. For Tag‐SNP with BayesA method accuracy values ranged from 0.13 to 0.30 for k‐means and from 0.30 to 0.65 for random clustering of animals to compose reference and validation groups. Although genomic prediction accuracies were higher with the full marker panel, predictions with low‐density panels retained on average 76% of the accuracy obtained with BayesB with full markers for growth traits. The MeSH analysis was able to translate genom... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Gado Braford. |
Thesagro: |
Gado de Corte; Gado Hereford; Seleção. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02608naa a2200277 a 4500 001 2125369 005 2020-10-08 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1111/jbg.12458$2DOI 100 1 $aCAMPOS, G. S. 245 $aTag-SNP selection using Bayesian genomewide association study for growth traits in Hereford and Braford cattle.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aThe aim of this study was to perform a Bayesian genomewide association study (GWAS) to identify genomic regions associated with growth traits in Hereford and Braford cattle, and to select Tag‐SNPs to represent these regions in low‐density panels useful for genomic predictions. In addition, we propose candidate genes through functional enrichment analysis associated with growth traits using Medical Subject Headings (MeSH). Phenotypic data from 126,290 animals and genotypes for 131 sires and 3,545 animals were used. The Tag‐SNPs were selected with BayesB (π = 0.995) method to compose low‐density panels. The number of Tag‐single nucleotide polymorphism (SNP) ranged between 79 and 103 SNP for the growth traits at weaning and between 78 and 100 SNP for the yearling growth traits. The average proportion of variance explained by Tag‐SNP with BayesA was 0.29, 0.23, 0.32 and 0.19 for birthweight (BW), weaning weight (WW205), yearling weight (YW550) and postweaning gain (PWG345), respectively. For Tag‐SNP with BayesA method accuracy values ranged from 0.13 to 0.30 for k‐means and from 0.30 to 0.65 for random clustering of animals to compose reference and validation groups. Although genomic prediction accuracies were higher with the full marker panel, predictions with low‐density panels retained on average 76% of the accuracy obtained with BayesB with full markers for growth traits. The MeSH analysis was able to translate genomic information providing biological meanings of more specific gene products related to the growth traits. The proposed Tag‐SNP panels may be useful for future fine mapping studies and for lower‐cost commercial genomic prediction applications. 650 $aGado de Corte 650 $aGado Hereford 650 $aSeleção 653 $aGado Braford 700 1 $aSOLLERO, B. P. 700 1 $aREIMANN, F. A. 700 1 $aJUNQUEIRA, V. S. 700 1 $aCARDOSO, L. L. 700 1 $aYOKOO, M. J. I. 700 1 $aBOLIGON, A. A. 700 1 $aBRACCINI, J. 700 1 $aCARDOSO, F. F. 773 $tJournal of Animal Breeding and Genetics$gv. 137, n. 5, p. 449-467, Sept. 2020.
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